BIOINFO - 4N Preguntas de simulador

¿Qué comando usarías para contar el número de líneas en un archivo?. awk 'END {print NR}' archivo.txt. awk '{sum += $2} END {print sum}' archivo.txt. awk '{print $1}' archivo.txt. awk 'NF > 3' archivo.txt.

¿Qué efecto tiene el comando mkdir en el sistema de archivos?. Muestra el contenido de un archivo. Crea un nuevo archivo vacío. Borra un archivo existente. Crea un nuevo directorio.

¿Cuál comando imprimiría todas las líneas que contienen la palabra "error"?. awk 'NF > 3' archivo.txt. awk 'length($0) > 20' archivo.txt. awk '{gsub(/antiguo/, "nuevo"); print}' archivo.txt. awk '/error/' archivo.txt.

Si deseas eliminar un directorio que no está vacío, ¿qué comando usarías en lugar de rmdir?. cp. mv. touch. rm -r.

¿Qué comando se utiliza para limpiar la pantalla de la terminal?. man. touch. clear. exit.

Cuál de los siguientes comandos es usado para obtener información detallada sobre un comando en Linux?. ls. pwd. man. cd.

¿Cuál es la diferencia entre los comandos rmdir y rm?. Ambos comandos realizan la misma acción. rmdir borra archivos y rm borra directorios. rm es más seguro que rmdir. rmdir borra directorios vacíos y rm borra archivos o directorio.

¿Qué comando se usa para ver el historial de comandos ejecutados en la terminal de Ubuntu?. man. sudo. history. pwd.

Para obtener ayuda sobre un comando específico en Linux, ¿qué comando podrías utilizar?. Todas las anteriores. help. info. man.

Para crear un archivo vacío llamado archivo.txt, ¿cuál de los siguientes comandos es correcto?. touch archivo.txt. cp archivo.txt. man archivo.txt. mkdir archivo.txt.

¿Qué comando permite mostrar el contenido de un archivo en la terminal?. pwd. cat. rmdir. touch.

¿Qué comando utilizarías para mostrar la ruta completa del directorio actual?. cd. ls -l. man. pwd.

¿Cuál es el propósito principal del comando sudo en Ubuntu?. Crear un nuevo archivo vacío. Cambiar el directorio de trabajo. Listar el contenido de un directorio. Ejecutar comandos con privilegios de root.

¿Qué comando borrarías para eliminar un archivo llamado datos.txt?. cp datos.txt. rm datos.txt. mv datos.txt. rmdir datos.txt.

¿Qué comando puede usarse para crear varios directorios al mismo tiempo?. mkdir -p dir1 dir2 dir3. mkdir -r dir1 dir2 dir3. mkdir dir1 dir2 dir3. mkdir /dir1 /dir2 /dir3.

¿Cómo cambiarías el directorio de trabajo a /home/usuario usando la terminal?. ls -l /home/usuario. cd /home/usuario. mkdir /home/usuario. mv /home/usuario.

Si deseas copiar un archivo de un directorio a otro, ¿qué comando deberías usar?. cp. mv. rmdir. touch.

¿Qué diferencia existe entre ls y ls -l en la terminal de Ubuntu?. ls muestra solo archivos y ls -l solo directorios. Ambos comandos son equivalentes. ls muestra archivos ocultos y ls -l muestra solo archivos visibles. ls muestra los archivos y directorios en formato corto y ls -l muestra detalles adicionales.

¿Qué comando mostraría todas las interfaces de red activas en el sistema?. lsconfig. ifconfig. ipconfig. netconfig.

Para reiniciar una máquina virtual en Ubuntu, ¿qué acción es generalmente requerida después de actualizar el sistema?. Ejecutar sudo apt-get update. Cambiar el directorio de trabajo. Cerrar la terminal. Ejecutar sudo reboot.

¿Qué comando permite crear un archivo comprimido en formato .tar.gz desde la terminal?. gzip archivo.tar.gz /ruta. tar -xzvf archivo.tar.gz /ruta. tar -czvf archivo.tar.gz /ruta. zip -r archivo.tar.gz /ruta.

Para visualizar y filtrar líneas específicas que contengan un patrón en un archivo de texto, ¿qué comando es más adecuado?. find. sed. awk. grep.

``python from collections import Counter dna = "ATGCGTACCTGATCGTAGC" k = 3 kmers = [dna[i:i+k] for i in range(len(dna)-k+1)] conteo = Counter(kmers) print(len(conteo)) ``` ¿Qué devuelve len(conteo)?. El número de trímeros únicos en la secuencia. La frecuencia del codón ATG. El número de bases totales. El total de combinaciones posibles de trímeros.

```python gene1 = "ATGCGTACCTGATCGTAGCTAG" gene2 = "ATGCGTACCTGATCGTAGC" if len(gene1) > len(gene2): print("Gene1 es más largo") ``` ¿Qué mostrará en pantalla?. Error de sintaxis. Gene1 es más largo. Ambos genes son iguales. Gene1 es más corto.

```python from io import StringIO from Bio import SeqIO multi = ">A\nATGCTAGC\n>B\nGCGTAGCTAG\n" for rec in SeqIO.parse(StringIO(multi), "fasta"): print(rec.id, len(rec.seq)) ``` ¿Qué imprime el programa?. Los identificadores y las longitudes de cada secuencia. Solo el número total de registros. Las bases G y C de cada registro. Los IDs y las secuencias completas en una sola línea.

Dada la siguiente secuencia de ADN: ```python dna = "ATGCGTACCTGATCGTAGC" print(len(dna)) ``` ¿Qué imprime el programa y qué representa ese número?. 21, número de tripletes. 20, número de genes. 20, número de nucleótidos. 19, número de aminoácidos.

```python complemento = dna.translate(str.maketrans({"A":"T","T":"A","C":"G","G":"C"})) complemento_inverso = complemento[::-1] ``` ¿Qué operación se realiza?. Reversión de tripletes sin cambio. Obtención del complemento inverso del ADN. Cálculo del %GC. Generación del ARN mensajero.

```python def pasa_filtro(r): return (r["longitud"] >= 20) && (40.0 <= r["%GC"] && r["%GC"] <= 60.0) ``` ¿Qué hace la función?. Calcula el complemento inverso. Valida que solo contenga A, C, G y T. Cuenta codones de parada. Filtra secuencias por criterios biológicos de longitud y %GC.

```python seq = "ATGCGTACCTGATCGTAGCTAGCTAGGCTAGC" gc = (seq.count("G") + seq.count("C")) / len(seq) * 100 print(f"Contenido GC: {gc:.2f}%") ¿Qué mide esta operación?. El contenido de guanina y citosina sobre la longitud total. La cantidad total de codones. La proporción de bases nitrogenadas sin normalizar. El porcentaje de adeninas y timinas.

```python for nombre, sec in secuencias.items(): gc = (sec.count("G") + sec.count("C")) / len(sec) * 100 if gc > 50: print(f"{nombre} GC alto ({gc:.1f}%)") ``` Si gc es 60.3, ¿qué se imprimirá?. nombre GC bajo (60.3%). GC fuera de rango. nombre GC alto (60.3%). nombre GC medio (60.3%).

```python dna = "CCCATGAAACCC..." start = dna.find("ATG") ``` Si el codón de inicio está en la posición 3 (base 0), ¿qué valor devuelve start?. 0. 6. 3. 1.

Dado: ```python seq_rna = seq_dna.replace("T", "U") ``` ¿A qué proceso biológico equivale?. Alineamiento. Replicación. Traducción. Transcripción.