test 1 y 2 de genetica

¿Qué son enzimas de restricción?. Proteínas que sintetizan ADN a partir de ARN. Enzimas bacterianas que reconocen y cortan secuencias específicas de ADN llamadas sitios de restricción. Lípidos que degradan la membrana celular bacteriana. Carbohidratos que unen fragmentos de ADN.

¿Qué otra función desempeñan las enzimas de restricción?. Sintetizar proteínas a partir de ADN. Permitir extraer o aislar fragmentos de ADN para insertarlos en vectores como plásmidos. Degradar ARN mensajero. Reparar mutaciones espontáneas en el ADN.

¿Cuáles son los cortes realizados por enzimas de restricción?. Corte simple y corte doble. Corte helicoidal y corte lineal. Corte cohesivo y corte romo. Corte proximal y corte distal.

¿Qué es el corte cohesivo?. La enzima corta ambas hebras en el mismo punto, dejando ADN recto. La enzima corta las 2 hebras de ADN en punto desfasado y dejan fragmentos de una sola hebra sobresaliendo 5' o 3. La enzima corta solo una hebra de ADN. La enzima une dos fragmentos de ADN complementarios.

¿Qué es el corte romo?. La enzima corta ambas hebras en el mismo punto, sin dejar salientes, ADN termina recto. La enzima deja fragmentos sobresalientes de una sola hebra. La enzima corta el ADN en múltiples sitios aleatorios. La enzima solo corta ARN, no ADN.

¿Cuáles son las secuencias reguladoras y en dónde se colocan?. Promotores, intrones y exones; se ubican solo en el cromosoma Y. Enhancers, silencers, caja TATA y andamios; suelen ubicarse cerca o lejos del gen que regulan. Codones de inicio y stop; se ubican en el ARNt. Secuencias Shine-Dalgarno; se ubican en el ARNr.

¿Cuáles son los tipos de consensos?. Consenso iniciador, consenso elongador y consenso terminador. Consenso dador, consenso de ramificación y consenso acepto. Consenso 5', consenso 3' y consenso central. Consenso metilado, consenso acetilado y consenso fosforilado.

¿Qué es un consenso dador?. Secuencia al final del intrón rica en AG. Secuencia dentro del intrón que contiene una adenina conservada. Secuencia al inicio del intrón, generalmente rica en GU (en ARN), que marca el sitio donde comienza el corte del intrón. Secuencia en el exón que codifica el inicio de una proteína.

¿Qué es un consenso de ramificación?. Secuencia al inicio del intrón rica en GU. Secuencia dentro del intrón que contiene una adenina conservada llamada adenina de ramificación, participa en la formación del lazo durante el splicing. Secuencia al final del intrón rica en AG. Secuencia que marca el sitio de unión del ribosoma.

¿Qué es el consenso aceptor?. Secuencia al inicio del intrón rica en GU. Secuencia dentro del intrón con adenina de ramificación. Secuencia al final del intrón, generalmente rica en AG, donde se realiza el segundo corte del splicing. Secuencia que se une a la ARN polimerasa.

¿Qué son bacteriófagos?. Bacterias que infectan virus. Virus que infectan bacterias. Hongos que parasitan bacterias. Plásmidos que se replican dentro de bacterias.

¿Cómo infectan los bacteriófagos?. Se fusionan con la membrana bacteriana y liberan su contenido. Se adhieren a la superficie bacteriana e introducen su material genético (ADN o ARN) dentro de la bacteria. Son fagocitados por la bacteria. Secretan toxinas que matan a la bacteria y luego entran.

¿Cuáles son las partes de un bacteriófago?. Núcleo, mitocondrias y ribosomas. Cápside que contiene el material genético, cola que ayuda a inyectar ADN viral y fibras caudales que reconocen y se adhieren a bacteria. Membrana plasmática, pared celular y flagelos. Plásmido, cromosoma y plásmido.

¿Qué son los vectores de clonación?. Enzimas que cortan ADN en sitios específicos. Moléculas de ADN utilizadas como vehículos para el transporte y replicación de ADN extraño dentro de una célula huésped. Virus que infectan células eucariotas. Proteínas que transportan nutrientes al interior celular.

¿Cuáles son los vectores de clonación?. Plásmidos y cósmido. Bacteriófagos y priones. Ribosomas y lisosomas. Enzimas de restricción y ligasas.

¿Qué son los plásmidos?. De origen viral, capacidad de carga ilimitada. De origen bacteriano, su capacidad de carga no supera 10 kb y replica gen. De origen eucariota, capacidad de carga de 50 kb. De origen sintético, sin capacidad de replicación.

¿Cómo infecta un plásmido?. Mediante fusión de membranas. Mediante choque térmico o transformación química y electroporación, abriendo poros momentáneos por polaridad. Mediante inyección directa como un fago. Mediante endocitosis mediada por receptor.

¿Qué son los cósmidos?. Plásmidos naturales sin modificación. Mezcla sintética de plásmido + fago. En cabeza o cápside se almacena el plásmido. Capacidad de 30-40 kb. Virus que infectan hongos. Fragmentos de ADN lineal sin capacidad de replicación.

¿Cómo infectan los cósmidos?. Necesitan choque térmico como los plásmidos. No necesita choque, el fago actúa como vector viral e inyecta plásmidos. Se introducen por electroporación únicamente. Atraviesan la membrana por difusión pasiva.

¿Qué forma pueden adoptar los cósmidos para ingresar a su huésped?. Lineal y luego circular. Superenrollada. Bifurcada.

¿Qué son secuencias palindrómicas?. Secuencias de ADN que se leen igual en ambas hebras en dirección 5' → 3'. Secuencias que solo se encuentran en ARN. Secuencias que codifican proteínas de membrana. Secuencias que no tienen complementariedad.

¿Cuál es el nombre de las cadenas resultantes del dogma central en orden?. Cadena molde (3'→5'), cadena codificante (5'→3') y ARNm (3'→5'). Cadena codificante (5'→3'), molde (3'→5') y ARNm (5'→3'). Cadena líder (5'→3'), rezagada (3'→5') y ARNt (5'→3'). Cadena sentido (5'→3'), antisentido (3'→5') y ARNr (3'→5').

¿Qué dirección sigue la replicación?. 3' → 5'. 5' → 3'. Ambas direcciones simultáneamente. Dirección aleatoria.

¿Cuántos orígenes de replicación pueden darse de manera simultánea en replicación?. 1 solo. 100. 3000 en un proceso lineal. 10 en procariotas y 100 en eucariotas.

¿De qué naturaleza es la replicación?. Conservativa. Semiconservativa. Dispersiva. Aleatoria.

¿Cuál es el paso 4 de la replicación?. Helicasa rompe puentes de hidrógeno. Topoisomerasa desenrolla el ADN. Primasa sintetiza un pequeño fragmento de ARN llamado primer, que sirve como punto de inicio y aporta el grupo 3' OH libre. Ligasa une fragmentos de Okazaki.

¿Qué es PCR (reacción en cadena polimerasa)?. Técnica para secuenciar proteínas. Amplificación de productos específicos a partir de 1 gen. Método para extraer ADN de células. Proceso de traducción de ARN a proteínas.

¿Qué es necesaria para la PCR?. Diseño de marcador forward y reverse. Solo un primer. ARN polimerasa. Ribosomas y aminoácidos.

¿Qué procesos ocurren en PCR?. Transcripción, traducción y replicación. Desnaturalización, hibridación o anillamiento y elongación. Fosforilación, metilación y acetilación. Iniciación, elongación y terminación.

¿Qué elementos son usados en PCR?. ADN de estudio, dNTPs, Taq polimerasa, primers, tubo Eppendorf, termociclador. ARN, aminoácidos, ribosomas y ATP. Proteínas, lípidos, carbohidratos y agua. Enzimas de restricción, ligasas y fosfatasas.

¿Qué ocurre durante la desnaturalización en PCR?. Los primers se unen al ADN. Se desdobla el ADN, se separan cadenas a 90-95 °C; a mayor C y G, mayor temperatura. Los dNTPs se incorporan a la nueva cadena. La Taq polimerasa se inactiva.

¿Qué ocurre durante la hibridación o anillamiento en PCR?. Se separan las cadenas de ADN. Se colocan primers a 55-70 °C, se coloca Taq polimerasa; si temp muy alta no se une, si muy baja se une a donde sea. La ADN polimerasa sintetiza ADN. Los fragmentos de ADN se unen con ligasa.

¿Qué ocurre durante la elongación en PCR?. Se separan las cadenas a 95 °C. A 45-55 °C, los dNTPs se unen por complementariedad y se completa el ADN. Los primers se degradan. La Taq polimerasa se desnaturaliza.

¿Hasta cuántos ciclos puede alcanzar una PCR?. 10. 20. 30. 50.

¿Qué otros nombres tienen los primers?. Marcador molecular, oligonucleótidos. Polimerasas, ligasas. Nucleósidos, nucleótidos. Exones, intrones.

¿Por qué se usa magnesio en PCR?. Como fuente de energía. Debido a la polaridad de la PCR. Para inhibir la Taq polimerasa. Para aumentar la temperatura de fusión.

¿Qué son dNTPs?. Aminoácidos esenciales para la traducción. Nucleótidos que utiliza la ADN polimerasa para sintetizar una nueva hebra de ADN. Enzimas que cortan el ADN. Carbohidratos que forman la doble hélice.

¿Por qué se dice que Taq polimerasa es igual a ADN polimerasa?. Porque ambas degradan ADN. Porque su función es sintetizar ADN, agregando dNTPs al extremo 3' OH, en dirección 5' → 3. Porque ambas provienen de bacterias termófilas. Porque ninguna necesita primers.

¿Por qué se le añade aceite mineral al PCR en termociclador?. Para aumentar la temperatura. Para evitar la evaporación de la mezcla durante las altas temperaturas. Para inactivar la Taq polimerasa. Para mejorar la unión de los primers.

¿Cuál es una regla para elaborar un primer?. El % de C y G debe superar el 80%. El tamaño estándar es 18-20 nucleótidos; no debe superar 60% C/G ni ser menor de 40%. El primer debe ser de 50 nucleótidos para ser específico. No importa la composición de bases.

¿Qué pasa si el primer es muy largo para la Taq polimerasa?. Aumenta la eficiencia. Pierde efectividad. Se une más específicamente. Disminuye la temperatura de anillamiento.

¿Cómo se determina el porcentaje de C y G en un primer?. (A + T) / Tamaño × 100. (C + G) / Tamaño del primer × 100. (C + G) × 100 / (A + T). Tamaño / (C + G) × 100.

¿Qué son dímeros?. Moléculas que se repelen entre sí. Estructura formada por la unión de dos moléculas similares o compatibles; se pegan nucleótidos en sitios interespecíficos. Fragmentos de ADN de una sola hebra. Enzimas que cortan el ADN en sitios palindrómicos.

¿Cómo se determina el tiempo de anillamiento o hibridación (Tm)?. Tm = (A + T + C + G) × 2. Tm = 2 (A + T) + 4 (C + G). Tm = 4 (A + T) + 2 (C + G). Tm = (C + G) / (A + T) × 100.

Se desea realizar una clonación direccional utilizando dos enzimas de restricción que generan extremos cohesivos compatibles pero no idénticos (ej. BamHI y BglII). Tras la ligación de estos extremos, ¿qué ocurre con el sitio de restricción resultante en el DNA recombinante?. El sitio híbrido resultante generalmente no es reconocido por ninguna de las dos enzimas originales. Se regeneran ambos sitios de restricción de forma adyacente. El sitio resultante solo puede ser cortado por la enzima que aportó el extremo 5' sobresaliente. La DNA ligasa es incapaz de unir extremos cohesivos si las secuencias flanqueantes no son idénticas.

Para evitar la autoligación de un vector de clonación linealizado con una única enzima de restricción, se utiliza fosfatasa alcalina. ¿Cuál es el mecanismo molecular exacto por el cual esta enzima impide que el vector se cierre sobre sí mismo?. Degrada selectivamente los extremos cohesivos convirtiéndolos en extremos romos no reactivos. Elimina los grupos fosfato del extremo 5', impidiendo que la DNA ligasa forme el enlace fosfodiéster. Elimina los grupos hidroxilo del extremo 3', bloqueando el ataque nucleofílico. Metila las bases nitrogenadas terminales provocando un impedimento estérico para la ligasa.

En el sistema de cribado azul/blanco (alfa-complementación del gen lacZ), ¿qué fenómeno molecular está ocurriendo exactamente en las colonias que muestran un color blanco?. Se produce una sobreexpresión del represor LacI que bloquea por completo la transcripción de todo el operón. El inserto bloquea físicamente la entrada del sustrato cromogénico X-gal al interior de la célula bacteriana. La beta-galactosidasa mutada metaboliza el X-gal transformándolo en un compuesto incoloro en lugar de azul. La inserción del fragmento de DNA exógeno en el sitio de clonación múltiple interrumpe la pauta de lectura del fragmento alfa de la betagalactosidasa.

Si una molécula de DNA genómico circular de 40 kb posee 5 sitios de restricción para la enzima EcoRI, ¿cuántos fragmentos lineales se generarán tras una digestión completa y cómo afectaría una metilación parcial por una metilasa específica de EcoRI?. Se generarán 5 fragmentos; la metilación parcial induce cortes inespecíficos en secuencias no palindrómicas. Se generarán 5 fragmentos; la metilación parcial disminuirá el número de cortes aumentando el tamaño promedio de los fragmentos recuperados. Se generarán 4 fragmentos lineales y 1 circular; la metilación inhibe competitivamente a la ligasa. Se generarán 6 fragmentos; la metilación parcial no altera el patrón de bandas si la digestión se prolonga.