biotecno tema 3

MALDI vs. ESI ( tema 3). Mezcla: aromático+disolvente superficie metálica. compuesto orgánico->. La placa metálica se introduce en la cámara de ionización del espectrómetro de masas, que se encuentra en alto vacío->pulso de láser ultravioleta (UV). Los cristales absorben la energía del láser->una rápida sublimación->analito ionizado y en fase gaseosa. MALDI. Mezcla: tampón volátil+ pH ácido. Columna HPLC-> capilar metálico (alto voltaje)->espray de gotas. Corriente de gas temperatura, elimina a alta el disolvente restante y deja a los analitos ionizados y en fase gaseosa, hacia el analizador de masas. ESI.

RELACIONA ( TEMA 3). Experimental. Teórica.

Señala la correcta: ( tema 3). Mark Wilkins en 1994 acuñó el término “proteoma” para indicar el conjunto de proteínas expresadas en un organismo o sistema biológico. Mark Wilkins en 1994 acuñó el término “proteoma” para indicar el conjunto de proteínas expresadas en varios organismos o sistema biológico. AlphaFold en 1994 acuñó el término “proteoma” para indicar el conjunto de proteínas expresadas en un organismo o sistema biológico. AlphaFold en 1994 acuñó el término “proteoma” para indicar el conjunto de proteínas expresadas en varios organismo o sistema biológico.

¿Cuál de las siguientes afirmaciones No describe una característica fundamental del proteoma? ( tema 3). El proteoma es altamente diferente entre las distintas especies, organismos, células, tejidos o incluso compartimentos celulares. Es variable a lo largo de la vida, dependiendo de varios factores: El estado fisiológico (p.ej., embarazo) El estado patológico (p.ej., cáncer) El contexto biológico (medio) El estado de desarrollo del organismo. El conjunto de proteínas determina como “se comportará” el organismo en sus aspectos biológicos (respuestas, interacciones con fármacos, etc). Es altamente diferente entre distintas especies, pero idéntico en todas las etapas de desarrollo.

PROTEÓMICA:FRONTERAS: El estudio de los proteomas, presenta un grado de complejidad considerable: Señala la incorrecta (tema 3). El amplísimo rango dinámico de la concentración de proteínas en tejidos y especialmente en el plasma humano. La presencia de diferentes formas moleculares de cada proteína (múltiples mRNAs, por splicing, mRNA editing, modificaciones co- y post traduccionales). Diversidad estructural. Una gran mayoría de las proteínas actúan solas.

Dentro de las fronteras y complejidades del estudio de los proteomas, ¿ qué ocurre en el plasma humano? ( tema 3). Existe un amplísimo rango dinámico de la concentración de proteínas. Todas las proteínas se encuentran exactamente en la misma concentración. Las proteínas actúan siempre de forma aislada sin interactuar entre sí. No se producen modificaciones co- ni post-traduccionales.

RELACIONA: ( TEMA 3). Equipos MALDI-TOF, ventajas:. Equipos MALDI-TOF, inconvenientes.

¿Qué rama multidisciplinar se define como el estudio holístico de los organismos vivos que permite comprender cómo emergen las propiedades biológicas a partir de las interacciones de sus componentes? ( tema 3 ). Biología de Sistemas. Genómica Comparada. Proteómica Estructural. Cristalografía de Rayos X.

¿Cuál es el objetivo final a largo plazo de la proteómica a nivel de la biomedicina? ( tema 3). Clonar organismos de forma idéntica en estados patológicos. Desarrollar mejores métodos de diagnóstico y tratamiento de enfermedades. Eliminar por completo el ARN mensajero de las células humanas. Reducir la diversidad estructural de las macroasociaciones celulares.

¿Cuál de los siguientes factores NO se menciona explícitamente en el texto como causa de la variabilidad del proteoma? ( tema 3). El estado patológico (p.ej., cáncer). El estado de desarrollo del organismo. Las condiciones climáticas externas del laboratorio. El estado fisiológico (p.ej., embarazo).

¿Qué hito estructural detallado por herramientas bioinformáticas se relaciona directamente con enfermedades cardiovasculares y el cáncer? ( tema 3). Los lípidos de la membrana plasmática. Los poros nucleares (puertas de entrada y salida del núcleo). Los nucleosomas del ADN condensado. Las subunidades ribosomales aisladas.

En los analizadores de masas MALDI-TOF, ¿en qué principio físico se basa la separación en el tubo de tiempo de vuelo (TOF)? (tema 3). En la afinidad química entre los anticuerpos y los ligandos inmovilizados. En la relación entre la masa y la velocidad de los iones acelerados a través de una distancia (L). En la digestión enzimática exclusiva mediante tripsina. En la hibridación fluorescente de fragmentos de ADN monocatenario.

¿Qué caracteriza principalmente a la aproximación "Top-down" en la espectrometría de masas en tándem (MS/MS)? ( tema 3 ). El análisis directo de la proteína intacta en el espectrómetro antes de su fragmentación en la cámara de colisión. Una digestión previa obligatoria de la muestra empleando tripsina u otras enzimas. El uso exclusivo de microarrays de expresión de ADN K12. La inmovilización de anticuerpos inespecíficos sobre un chip de vidrio.

El método de identificación conocido como "Huella peptídica" (Peptide Mass Fingerprint, PMF) se realiza generalmente mediante la digestión enzimática con: ( tema 3 ). Quimiotripsina. Tripsina. Pepsina. Liasa.

¿Cuál es una de las principales aplicaciones de los microarrays o arrays de proteínas (chips analíticos)? (Tema 3). Almacenar ADN genómico para secuenciación masiva. Detección de interacciones proteína-proteína y evaluación de la actividad enzimática. Modificar el tiempo de vuelo de los iones en ausencia de campo eléctrico. Eliminar de forma absoluta las reacciones cruzadas de los anticuerpos.

¿Cuál es el problema o limitación técnica actual que presentan los chips analíticos respecto a sus agentes de captura? ( tema 3 ). No permiten procesar más de una proteína simultáneamente. Inespecificidad, reacciones cruzadas, orientación y falta de agentes de alta calidad para cuantificar mezclas complejas. Que requieren de forma obligatoria fuentes de ionización MALDI de código abierto. La imposibilidad absoluta de utilizar anticuerpos (Ab) como sondas.

¿Para qué se utilizan específicamente los denominados "Chips funcionales"? ( tema 3). Para medir de forma exclusiva el rango dinámico del plasma humano. Para determinar actividades bioquímicas e interacciones moleculares incubando proteínas inmovilizadas con distintos ligandos. Para realizar la digestión enzimática "Bottom-up" de péptidos intactos. Para sustituir por completo a los espectrómetros de masas en tándem.

Dentro de la proteómica cuantitativa, ¿ cómo se define operacionalmente la "cuantificación relativa"? ( tema 3). Determina la cantidad exacta en nanogramos (ng) o nmoles por gramo de tejido. Intenta únicamente identificar qué proteínas están presentes en una muestra compleja. Determina la tendencia de la regulación de una proteína hacia arriba o hacia abajo (aumentos o disminuciones). Mide la distancia exacta (L) recorrida por un ión en un analizador QQQ.

¿Cuál es el propósito u objetivo principal de la proteómica clínica? ( tema 3). Sintetizar proteínas artificiales a la carta mediante inteligencia artificial. Definir patrones de proteínas que generen información de valor clínico sobre la susceptibilidad, diagnóstico, pronóstico y terapia de enfermedades. Reducir el volumen de datos masivos derivados de poblaciones fenotipadas. Analizar de forma cualitativa las subunidades de los poros nucleares bacterianos.

De acuerdo con la diapositiva de la finalidad de la proteómica clínica, la metodología proteómica clásica para la búsqueda e identificación de biomarcadores individuales combina: ( tema 3). Chips funcionales y secuenciación genómica. Separación de proteínas e identificación por espectrometría de masas. Inmunodeplección y motores de búsqueda de bases de datos de ADN. Cuantificación absoluta mediante fluorescencia Dylight 550.

En la estrategia fundamental de la proteómica clínica, ¿en qué consiste el análisis de la expresión diferencial? ( tema 3). En secuenciar únicamente mutaciones genómicas en líneas celulares in vitro. En comparar perfiles proteicos entre muestras de controles sanos y muestras patológicas. En aislar los lípidos de las membranas celulares en una sola dimensión cromatográfica. En predecir mediante IA la estructura tridimensional de proteínas bacterianas sintéticas.

Para que un biomarcador proteico identificado en fluidos biológicos tenga un uso clínico óptimo, las diapositivas destacan que debe ser medible preferentemente en: ( tema 3). Líquido cefalorraquídeo exclusivamente. Secreciones del secretoma celular in vitro. Suero o plasma del paciente. Fragmentos de explante tisular criogenizado.

Dentro del esquema de "Búsqueda de nuevos biomarcadores", ¿ cuál de las siguientes opciones se clasifica como una aproximación inductiva? ( tema 3 ). Los estudios epidemiológicos moleculares. La proteómica. La pre-selección teórica de candidatos. El cribado clínico de fase III.

De acuerdo con el texto de los objetivos bioinformáticos, ¿por qué es particularmente necesario la creación de un "Banco de Muestras Clínicas" (Biobancos)? ( tema 3 ). Para acelerar los tiempos de secuenciación de ARN mediante plataformas Illumina. Para demostrar la especificidad diagnóstica del perfil proteico (su ausencia en controles y presencia en la patología). Para evitar el procesamiento analítico de datos masivos multivariables. Para sustituir los ensayos espectrométricos SRM por técnicas electroforéticas de tipo DIGE.

En el ejemplo práctico de la línea temporal de proteómica clínica (" Proteomics Timeline"), ¿ cuál es el tiempo total requerido desde la cirugía y preparación de la muestra hasta la obtención de los resultados finales del análisis bioinformático? ( tema 3). 100 minutos exactos. 1 mes completo. 2,5 días. 7 días laborables.

Durante el proceso de síntesis y desarrollo de nuevos Principios Activos (PA), ¿en qué fase se engloba específicamente el "Molecular Docking" (acoplamiento molecular)? ( tema 3 ). Fase Clínica (Clinical trials). Fase Preclínica (Pre-clinical phase), dentro del descubrimiento y optimización de líderes (Lead discovery & optimization). Fase de validación de biomarcadores en cohortes de pacientes. Fase post-aprobación del fármaco por las agencias reguladoras.

Según el esquema de flujos de entrada y salida en el desarrollo de fármacos (Drug Discovery and Development), ¿cuál de las siguientes opciones constituye un "Outcome" o beneficio directo para el paciente? ( tema 3). Los datos de transcriptómica, genómica y proteómica combinados. El fenotipo clínico y patológico de la cohorte estudiada. Un mayor valor de intervención médica y un mejor pronóstico/resultado clínico del paciente. La reducción drástica de las reacciones cruzadas en chips analíticos.

¿Cuál es el paralelismo o analogía fundamental que establece la "Aleatorización Mendeliana" (Mendelian Randomisation) con respecto a un ensayo clínico controlado convencional? ( tema 3). Que utiliza la asignación aleatoria de alelos genéticos durante la concepción para emular la asignación aleatoria de un fármaco. Que requiere obligatoriamente que todos los pacientes reciban un tratamiento con estatinas de por vida. Que anula por completo la variabilidad genética natural entre individuos de una misma población. Que sustituye la medición proteómica cuantitativa por el análisis de lípidos plasmáticos.

Al evaluar la Aleatorización Mendeliana, ¿cuál de los siguientes puntos se destaca explícitamente como una de sus grandes FORTALEZAS metodológicas? ( tema 3 ). Su alta sensibilidad para detectar efectos raros o poco frecuentes en la población. Que es mucho más robusta frente a la causalidad inversa (Reverse causation). Que no requiere de estudios de asociación genética a gran escala. Que elimina el sesgo derivado del desequilibrio de ligamiento genético.

En las DEBILIDADES enumeradas de la Aleatorización Mendeliana, el término "Pleiotropía horizontal" (Horizontal pleiotropy) se considera un inconveniente porque: ( tema 3). Reduce los costes asociados al análisis informático de las muestras. Permite utilizar la herramienta antes o después de la aprobación de un fármaco. Puede guiar a la pérdida de detección de efectos o generar resultados conflictivos debido a variantes genéticas con múltiples efectos biológicos paralelos. Minimiza de forma absoluta el sesgo de selección asociativa.