Secuenciación de Nueva Generación

La Secuenciación de Nueva Generación o NGS se define como: Una técnica que permite observar cromosomas mediante microscopía. Un conjunto de tecnologías que determina el orden de los nucleótidos del ADN o ARN. Una prueba que únicamente amplifica fragmentos de ADN. Un procedimiento para modificar genes mediante enzimas.

La principal característica que diferencia a la NGS de la secuenciación tradicional es que permite: Analizar millones de fragmentos simultáneamente. Analizar únicamente un nucleótido por prueba. Estudiar exclusivamente proteínas. Eliminar las variantes genéticas benignas.

Antes del desarrollo de la NGS, el método de referencia para estudiar secuencias de ADN era: PCR en tiempo real. Secuenciación de Sanger. Cariotipo. Hibridación in situ.

¿Cuál es una limitación de la secuenciación de Sanger?. Analiza uno o pocos fragmentos de ADN en cada reacción. No permite identificar ningún nucleótido. Solo puede utilizarse en ARN. Siempre produce variantes de significado incierto.

La secuenciación masiva en paralelo consiste en: Leer millones de fragmentos de ADN simultáneamente. Analizar exclusivamente un gen por paciente. Secuenciar únicamente el ADN mitocondrial. Comparar proteínas con un genoma de referencia.

El objetivo principal de la NGS es: Identificar variaciones del ADN o ARN con posible relevancia clínica. Modificar directamente todas las mutaciones encontradas. Producir proteínas recombinantes. Eliminar las enfermedades hereditarias.

Para identificar diferencias genéticas, las secuencias del paciente se comparan con: Un genoma de referencia. Una secuencia bacteriana. El ADN mitocondrial materno exclusivamente. Una muestra sin material genético.

Los seres humanos comparten aproximadamente: 50% de su información genética. 75% de su información genética. 99.9% de su información genética. 100% de su información genética.

La mayoría de las variantes encontradas mediante NGS: Son patogénicas. Forman parte de la variabilidad genética normal. Producen enfermedades hereditarias graves. Corresponden a alteraciones cromosómicas completas.

Una variante de significado incierto o VUS es aquella: Confirmada como causante de una enfermedad. Frecuente y completamente benigna. Cuyo impacto clínico todavía no puede determinarse. Que siempre requiere tratamiento inmediato.

Una variante se considera patogénica cuando: Existe evidencia de que altera una función biológica y causa enfermedad. Se presenta con frecuencia en la población sana. No modifica la estructura ni función de una proteína. Su significado todavía es desconocido.

¿Cuál asociación entre gen y enfermedad es correcta?. CFTR – fibrosis quística. HBB – enfermedad de Huntington. HTT - anemia falciforme. BRCA1 - intolerancia a la lactosa.

La anemia de células falciformes se relaciona con una variante patogénica en el gen: HTT. HBB. LCT. OCA2.

La enfermedad de Huntington se produce principalmente por: Una deleción completa del gen CFTR. Expansión anormal de repeticiones CAG en el gen HTT. Duplicación del gen HBB. Pérdida de los genes BRCA1 y BRCA2.

Las variantes en BRCA1 y BRCA2 aumentan principalmente el riesgo de: Cáncer hereditario de mama y ovario. Fibrosis quística. Enfermedad de Huntington. Intolerancia a la lactosa.

Según los criterios del ACMG, las variantes genéticas se clasifican como: Benignas, probablemente benignas, VUS, probablemente patogénicas y patogénicas. Dominantes, recesivas, mitocondriales, somáticas y germinales. Leves, moderadas, graves, agudas y crónicas. Genómicas, cromosómicas, proteicas, celulares y metabólicas.

¿Cuál es el primer paso del procedimiento de NGS?. Interpretación clínica de las variantes. Obtención de una muestra biológica. Comparación con el genoma de referencia. Clasificación según el ACMG.

¿Cuál es la muestra más utilizada en genética clínica para realizar NGS?. Sangre periférica. Bilis. Líquido sinovial. Jugo gástrico.

Después de extraer el ADN, se evalúan principalmente: Su cantidad y calidad. La glucosa y el colesterol. El grupo sanguíneo del paciente. La concentración de proteínas plasmáticas.

¿Por qué el ADN debe fragmentarse antes de la secuenciación?. Porque su longitud completa es demasiado grande para ser leída directamente. Porque es necesario eliminar todos los genes. Porque los fragmentos grandes no contienen nucleótidos. Porque la fragmentación corrige las mutaciones.

Durante la preparación de la biblioteca genética se añaden a los fragmentos de ADN: Adaptadores. Aminoácidos. Anticuerpos. Fosfolípidos.

Los barcodes o identificadores moleculares permiten: Analizar muestras de varios pacientes en una misma corrida. Eliminar las variantes benignas antes de secuenciar. Modificar directamente los genes patogénicos. Sustituir el análisis bioinformático.

¿Cuál es la función principal del análisis bioinformático en la NGS?. Alinear las secuencias con un genoma de referencia e identificar variantes. Extraer físicamente el ADN de la muestra. Fragmentar el ADN mediante ultrasonido. Obtener células del paciente.

Una variante de un solo nucleótido o SNV consiste en: Sustituir una base nitrogenada por otra. Duplicar un cromosoma completo. Eliminar todos los exones de un gen. Aumentar el número total de cromosomas.

Las inserciones y deleciones reciben conjuntamente el nombre de: Indels. CNV. VUS. SNV.

Las variantes en el número de copias o CNV corresponden a: Duplicaciones o pérdidas de fragmentos de ADN. Sustituciones de una sola base. Cambios exclusivos en el ARN. Expansiones de aminoácidos.

¿Cuál tipo de estudio es más apropiado cuando existe una sospecha clínica bien definida?. Panel de genes específicos. Secuenciación del genoma completo en todos los casos. Cariotipo convencional exclusivamente. Secuenciación únicamente del ADN mitocondrial.

La secuenciación del exoma completo o WES analiza: Todos los exones o regiones codificantes. Únicamente las regiones no codificantes. Solo el ADN mitocondrial. Exclusivamente los telómeros.

La secuenciación del genoma completo o WGS estudia: Regiones codificantes y no codificantes del ADN. Únicamente los exones. Solo genes relacionados con una enfermedad específica. Exclusivamente variantes del cromosoma X.

¿Cuál enunciado resume correctamente una ventaja y una limitación de la NGS?. Analiza múltiples genes simultáneamente, pero puede detectar variantes de significado incierto difíciles de interpretar. Solo analiza un gen, pero siempre establece un diagnóstico definitivo. Detecta todas las alteraciones con precisión absoluta y no genera dilemas éticos. No requiere bioinformática ni integración con los datos clínicos.